Fragmentomics: Blutbasierter Lungenkrebs-Test soll Screenings in unterversorgten US-Gemeinden ermöglichen

City of Hope, eines der größten Krebsforschungszentren in den Vereinigten Staaten, und DELFI Diagnostics wollen die Screening-Raten der labormedizinisch unterversorgten Gemeinden im Bezirk Los Angeles verbessern.

Dazu wird ein neuartiger, blutbasierter Lungenkrebstest im Rahmen einer klinischen Studie kostenlos angeboten.

Der Test basiert auf der recht neuen Forschungssparte Fragmentomics. Grundlage ist die Erkenntnis, dass Krebszellen beim Absterben verräterische Muster und Merkmale von frei zuirkulierenden, zellfreien DNA-Fragmenten (cfDNA) im Blut hinterlassen.

Die nun eingesetzte DELFI-Plattform wende eine fortschrittliche Technologie des maschinellen Lernens auf Ganzgenom-Sequenzierungsdaten an, um die cfDNA-Fragmente einer Person im Vergleich zu Populationen mit und ohne Krebs zu bewerten.

Lungenkrebs ist die häufigste Krebstodesursache in den USA und weltweit. Dennoch lassen sich nur sechs Prozent der in Frage kommenden Personen in den USA untersuchen, und in Kalifornien sinkt diese Zahl auf 0,7 Prozent.

Dieser Test wurde von der FDA bislang weder zugelassen noch genehmigt.


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DNA-Helix in B-Konformation (Struktur­modell): Die Stickstoff (blau) enthaltenden Nukleinbasen liegen waagrecht zwischen zwei Rückgratsträngen, welche sehr reich an Sauerstoff (rot) sind. Kohlenstoff ist grün dargestellt. Credits: Wikipedia/ CC BY-SA 3.0

DNA-Helix in B-Konformation (Struktur­modell): Die Stickstoff (blau) enthaltenden Nukleinbasen liegen waagrecht zwischen zwei Rückgratsträngen, welche sehr reich an Sauerstoff (rot) sind. Kohlenstoff ist grün dargestellt. Credits: Wikipedia/ CC BY-SA 3.0